1989年，日本。　　乔纳森·乔斯达与DIO决战后的一百年，DIO复活了。同时，乔瑟夫的孙子，空条承太郎发现自己有幽波纹（替身）能力，DIO的复活影响了没有替身抵抗能力的母亲，陷入病危情况；为了拯救命在旦夕的母亲，承太郎与乔瑟夫出发…

1989年，日本。　　乔纳森·乔斯达与DIO决战后的一百年，DIO复活了。同时，乔瑟夫的孙子，空条承太郎发现自己有幽波纹（替身）能力，DIO的复活影响了没有替身抵抗能力的母亲，陷入病危情况；为了拯救命在旦夕的母亲，承太郎与乔瑟夫出发…

由于童年的悲惨遭遇，直枝理树（堀江由衣 配音）的个性变得十分孤僻。长着一张娃娃脸，沉默寡言，没有朋友，这样的理树成为了大家眼里的怪胎。某一日，性格傲娇爱猫如命的枣铃（民安智惠 配音），正直开朗稳重可靠的枣恭介（绿川光 配音…

幼时曾深陷绝望深渊的直枝理树，与4位少年少女相遇了。　　在那之后数年，理树作为Little Busters的一员，喧闹地过着快乐的每一天。　　这样的时间能够一直持续就好了。理树所期望的只有这样。　　某日，恭介突然表示要成立一支棒球队伍…

岛津丰久，一名活跃于战国时代后期的年轻豪杰。在一场撤退战中，为了掩护友军平安脱困而身受重伤。不料眼一眨，却赫见一名不明人物出现在眼前，并打开一扇门引他进入另一个由许多不同时空交错而成的奇幻世界。而从这一刻起，他便成了在这…

西历2011年，美国·佛罗里达州。　　在与恋人兜风途中遇到了交通事故的空条徐伦，因被陷害而获刑15年。深陷绝望之中的徐伦，在手握父亲所托的吊坠时，觉醒了不可思议的力量。徐伦面前出现的神秘少年，不断发生的不可思议的事件，前来探视…