一个秘密军事基地，一组科学家发明了比当年的原子弹更厉害的发明，项目的代码为“爆发者”，但是“爆发者”发生了故障，一位最重要的科学家和暗物质一起爆炸，他得到了控制天气的超能力，可是他和该设备一样成为正在威胁世界安全的因素。

五年的追逐化为泡影，随着X档案的关闭，福克斯·穆德（大卫·杜楚尼 David Duchovny 饰）和丹娜·斯科莉（吉莲·安德森 Gillian Anderson 饰）被迫调任处理一些平常的案件。某天，美国得州达拉斯市发生一起爆炸案。虽然穆德和斯科莉极力…